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西湖大學(xué)研究團隊又獲重大突破:深度解密新冠病毒侵染人體一刻

發(fā)布時間:2020-02-21 10:55 分享到:

西湖大學(xué)周強實驗室再次取得重大突破。

北京時間2月21日凌晨,周強研究團隊在論文預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv再次發(fā)文,報道新冠病毒表面S蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域與細胞表面受體ACE2全長蛋白的復(fù)合物冷凍電鏡結(jié)構(gòu),揭開了新冠病毒入侵人體細胞的神秘面紗。

就在2天前,該團隊剛剛在bioRxiv上首次發(fā)布了新冠病毒受體ACE2全長結(jié)構(gòu)。

這兩篇預(yù)印本論文的第一作者為西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士后鄢仁鴻,通訊作者為西湖大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員周強。第一單位和通訊單位均為西湖大學(xué)浙江省結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究重點實驗室。這也是西湖大學(xué)承擔(dān)的浙江省“新型冠狀病毒肺炎防治應(yīng)急攻關(guān)項目”取得的重要成果,得到浙江省、杭州市相關(guān)部門和西湖區(qū)的大力支持。

侵入——

病毒“劫持”人體蛋白

ACE2中文名稱“血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2”。它作為膜蛋白,廣泛存在于人體的肺、心臟、腎臟和腸道的細胞中,控制人體血壓平衡。S蛋白則存在于冠狀病毒的刺突之上。SARS病毒和新冠病毒均屬于冠狀病毒。

新冠病毒S蛋白有如“強盜”,會“劫持”ACE2作為“人質(zhì)”。

疫情爆發(fā)后,武漢病毒研究所的科學(xué)家發(fā)現(xiàn),新冠病毒和SARS病毒一樣,也是通過識別ACE2進入人體細胞的。ACE2作為病毒的受體,是新冠病毒侵入人體的關(guān)鍵。

西湖大學(xué)特聘研究員陶亮進一步比喻:“我們可以把人的身體比喻成一個房屋。ACE2就像是房屋的‘門把手’。在新冠病毒侵入人體的過程中,S蛋白通過抓住‘門把手’,便打開了進入人體細胞的大門?!?/p>

最近美國得克薩斯大學(xué)奧斯汀分校的研究團隊展示了新冠病毒的S蛋白全長結(jié)構(gòu)。

然而,ACE2到底在細胞膜上是以什么狀態(tài)存在?新冠病毒對比SARS病毒與ACE2結(jié)合有何異同?

要解答這些問題,僅解析“敵人”的相貌還遠遠不夠。

聚焦——

看清“敵我”,百戰(zhàn)不殆

要想百戰(zhàn)不殆,知彼,也需知己??辞宕嬖谟谌梭w內(nèi)的ACE2的完整蛋白結(jié)構(gòu),就看清了自己。

獲得ACE2的全長蛋白結(jié)構(gòu),因而也是研究團隊攻堅的第一步。

ACE2難以在體外穩(wěn)定獲得。周強以及鄢仁鴻在大量的文獻中發(fā)現(xiàn),ACE2與腸道內(nèi)的一個氨基酸轉(zhuǎn)運蛋白B0AT1可以形成復(fù)合物。經(jīng)試驗,他們獲取了ACE2與B0AT1優(yōu)質(zhì)穩(wěn)定的復(fù)合物,從而取得了ACE2的全長蛋白結(jié)構(gòu)。

基礎(chǔ)科學(xué)的成果并非一蹴而就。過去兩年,周強實驗室一直在研究人源氨基酸轉(zhuǎn)運蛋白,他們鎖定了數(shù)種目標(biāo)蛋白,ACE2就是其中一種。而后,新冠肺炎疫情爆發(fā),周強團隊迅速將ACE2研究工作的優(yōu)先級提升,以最快速度取得研究成果,為后續(xù)藥物設(shè)計和研發(fā)提供關(guān)鍵信息。

通過分析ACE2的全長蛋白結(jié)構(gòu),周強實驗室發(fā)現(xiàn)ACE2以二聚體形式存在,同時具有開放和關(guān)閉兩種構(gòu)象變化,但兩種構(gòu)象均含有與新冠病毒的相互識別界面。

“總體而言,ACE2全長結(jié)構(gòu)的解析,將有助于理解冠狀病毒進入靶細胞的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和功能特征,對發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化阻斷進入細胞的抑制劑有重要作用”,清華大學(xué)全球健康與傳染病研究中心主任張林琦教授說。

推進——

復(fù)原病毒“開門”一刻

有了ACE2全長蛋白結(jié)構(gòu),周強實驗室進而解析了全長ACE2與新冠病毒S蛋白受體結(jié)合域的復(fù)合結(jié)構(gòu)。

本端記者在周強實驗室的電腦上,看見到了最新獲取的復(fù)合結(jié)構(gòu)界面圖。隨著鼠標(biāo)的拖動,圖片展示出不同角度的三維透視效果。

“它相當(dāng)于全方位展示了新冠病毒S蛋白握住‘門把手’那一刻時,病毒和ACE2的狀態(tài)?!敝軓娬f。

那么,這次解析出來的復(fù)合物結(jié)構(gòu)上透露了什么?

周強實驗室研究團隊發(fā)現(xiàn),新冠病毒的S蛋白看似一座橋橫跨在ACE2表面,又像病毒的一只手,緊緊抓住ACE2。這一點與SARS病毒侵入的樣子很相似。

而且,新冠病毒S蛋白的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域與SARS病毒的序列也非常像,相似性達到82%。但進一步分析又發(fā)現(xiàn),對比SARS與ACE2的相互作用,新冠病毒S蛋白與ACE2結(jié)合的氨基酸殘基中,有一部分發(fā)生了較大改變。

“這也許可以解釋為什么新冠病毒和SARS病毒與ACE2的結(jié)合能力不一樣。這種結(jié)合能力可能影響了病毒的傳染力?!辈贿^,影響究竟是增強還是減弱,周強表示,還需要通過其他實驗手段驗證。

作用——

為藥物設(shè)計提供有力幫助

科研要知其然,也要知其所以然。獲取病毒“開門”一刻,并對此進行分析,將對防疫抗疫產(chǎn)生重要意義。

“知道鎖孔長啥樣,然后照這個配鑰匙。不然就要用無數(shù)個鑰匙去試哪個可以開門?!?一位網(wǎng)友曾如此評價這項研究的價值。

換言之,看清了“鎖孔”,就可找到一個匹配的“盾牌”堵住它。人體的大門也就不會被病毒打開。

此前有研究顯示:每個冠狀病毒的S蛋白上,約有1300多個氨基酸。新冠病毒S蛋白上,有300多個氨基酸負責(zé)與ACE2相互作用。相當(dāng)于這些氨基酸共同握著能夠打開人體大門的鑰匙。

有沒有可能模擬一種蛋白,不是病毒,又能把受體先飽和住,從而阻攔病毒與受體的相互作用?有沒有可能把受體與病毒結(jié)合的表面進行優(yōu)化,并且把它轉(zhuǎn)移到某個抗體的骨架上,從而設(shè)計出更加強有力的綜合抗體,作為抑制病毒的手段?

“理解了新冠病毒侵染細胞的機理,就是希望為藥物設(shè)計提供有力的幫助?!敝軓娬J為,在解析全長ACE2與新冠病毒S蛋白受體結(jié)合域的復(fù)合結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,許多進一步的探索都將有了一些方向。


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